advertisement

Mga pagsusi sa diagnostic para sa COVID-19: Usa ka Pagtimbang-timbang sa Kasamtangang Pamaagi, Mga Praktis ug Umaabot

Ang mga pagsulay sa laboratoryo alang sa pagdayagnos sa COVID-19 nga karon gipraktis sumala sa gitambag sa internasyonal nga mga lawas sa mga eksperto gisusi ug gisusi.

Ang COVID-19 sakit, nga naggikan sa Wuhan China, nakaapekto sa labaw sa 208 ka mga nasud hangtod karon. Ang siyentipikanhong komunidad sa tibuok kalibutan adunay dakong hagit sa milabay nga pipila ka bulan, nga molambo mga pagsusi sa diagnostic alang sa Covid-19 pagtuki sa sakit aron masusi ang mga pasyente ug gidudahang mga indibidwal aron epektibo nga madumala ug makontrol ang pandemya.

Sa dili pa nato susihon ang kasamtangang mga pamaagi ug praktis nga gigamit sa pag-ila sa COVID-19, atong sabton una kung unsa ang hinungdan sa COVID-19 ug kung giunsa paghimo ang usa ka diagnostic nga pagsulay aron masusi ang mga pasyente alang sa kini nga sakit. Ang sakit nga COVID-19 gipahinabo sa usa ka positibo nga na-stranded nga RNA virus nga mga zoonotic, nga nagpasabot nga sila makatabok sa mga babag sa mga espisye gikan sa mga mananap ngadto sa mga tawo, ug mahimong hinungdan, sa mga tawo, mga sakit gikan sa komon nga katugnaw ngadto sa mas grabe nga mga sakit sama sa MERS ug SARS. Ang virus nga hinungdan sa COVID-19 ginganlan na karon og SARS-CoV-2 sa International Committee of Taxonomy of Viruses (ICTV), tungod kay susama kaayo kini sa hinungdan sa SARS outbreak (SARS-CoVs). Ang diagnostic test alang sa COVID-19 nga sakit mahimong maugmad sa daghang paagi.

Ang labing popular ug karon gisagop nga pamaagi sa tibuok kalibutan mao ang paghimo og diagnostic test nga makamatikod sa SARS-CoV-2 virus mismo. Kini pagsulay gibase sa pagkakita sa viral genome sa sample sa pasyente pinaagi sa RT-real time PCR (reverse transcriptase-real time Polymerase Chain Reaction). Naglangkob kini sa pagbag-o sa viral RNA ngadto sa DNA gamit ang usa ka enzyme nga gitawag og reverse transcriptase ug dayon pagpadako sa DNA gamit ang piho nga set sa mga primer ug usa ka fluorescent probe, nga nagbugkos sa usa ka piho nga rehiyon sa viral DNA, gamit ang Taq polymerase ug pag-detect sa fluorescent signal. Kini nga mga pagsulay gitawag nga NAATs (Nucleic Acid Amplification Tests). Kini nga teknik mahimong mapuslanon kaayo alang sa sayo kaayo nga pag-ila sa presensya sa nucleic acid sa sample sa pasyente, bisan sa mga asymptomatic nga mga pasyente nga wala magpakita sa mga sintomas sa sakit nga COVID-19 (ilabi na sa panahon sa paglumlum sa 14-28 ka adlaw) ug sa ulahing bahin. ingon man kung ang sakit hingpit na.

Ang lainlaing mga kompanya sa tibuuk kalibutan nagtrabaho sa usa ka lumba batok sa oras sa miaging pipila ka bulan aron mapalambo ang NAAT based diagnostic test alang sa pag-ila sa SARS-CoV-2 base sa CDC (Centre for Disease Control), Atlanta, USA ug WHO nga mga giya ( 1, 2). Giaprobahan sa mga awtoridad sa kahimsog sa tibuuk kalibutan kini nga mga pagsulay alang sa emerhensya nga paggamit alang sa pag-ila sa SARS-CoV-2. Ang mga viral nga gene nga gipuntirya sa pagkakaron naglakip sa N, E, S ug RdRP nga mga gene, uban sa angay nga positibo ug negatibo nga mga kontrol. Ang mga sample sa pasyente nga kolektahon para sa maong pagsulay kay gikan sa upper respiratory tract (nasopharyngeal ug oropharyngeal swab) ug/o lower respiratory tract (sputum ug/o endotracheal aspirate o bronchoalveolar lavage). Bisan pa, posible usab nga makit-an ang virus sa ubang mga sample, lakip ang hugaw ug dugo. Ang mga sample kinahanglan nga dali nga makolekta sa usa ka angay nga paagi nga nagkuha sa tanan nga kinahanglan nga pag-amping ug pagsunod sa mga pamaagi sa biosafety (sumala sa mga panudlo nga gilatid sa WHO [1]), gikan sa mga pasyente nga nakatagbo sa gidudahang kahulugan sa kaso alang sa COVID-19, pagpreserbar ug pagputos niini. maayo kung kini kinahanglan nga madala sa diagnostic center ug dayon iproseso (pagkuha sa RNA sa usa ka kabinet sa biosafety sa usa ka BSL-2 o katumbas nga pasilidad) nga paspas sa usa ka paagi aron masiguro ang integridad sa sample. Ang tanan nga kini kinahanglan nga buhaton sa usa ka prayoridad nga basehan alang sa mas maayo nga klinikal nga pagdumala ug outbreak control.

Ang oras sa pagkakita alang sa lainlaing magamit nga mga pagsulay nga nakabase sa NAAT nga gihimo sa mga dagkong kompanya sa diagnostic sa tibuuk kalibutan magkalainlain gikan sa 45 min hangtod 3.5 ka oras. Ang lainlaing mga pag-uswag gihimo sa kini nga mga pagsulay aron mabag-o kini sa mga pagsulay sa pag-atiman sa punto ug makab-ot ang gitinguha nga mga resulta sa labing gamay nga oras kutob sa mahimo nga wala ikompromiso ang katukma sa resulta, aron madugangan ang gidaghanon sa mga pagsulay nga mahimo sa usa ka adlaw.

Ang ubang mga opsyon sa diagnostic test mao ang paspas nga diagnostic nga mga pagsulay (RDTs) nga ma-detect ang mga viral antigens/protein nga gipahayag sa ibabaw sa mga partikulo sa virus sa SARS-CoV-2 samtang kini nag-replika sa mga host cell ug nagpahinabog sakit o host antibodies agig tubag sa impeksyon; kini nga pagsulay nakamatikod sa presensya sa mga antibodies sa dugo sa mga tawo nga gituohan nga nataptan sa COVID-19 (3).

Ang katukma ug reproducibility sa RDT sa pag-detect sa mga viral antigens nagdepende sa daghang mga hinungdan lakip na ang oras gikan sa pagsugod sa sakit, ang konsentrasyon sa virus sa sample, ang kalidad ug pagproseso sa sample, ug ang pagporma sa mga reagents nga anaa sa mga test kits. Tungod sa kini nga mga variable, ang pagkasensitibo sa kini nga mga pagsulay mahimong magkalainlain gikan sa 34% hangtod 80%. Ang usa ka dakong disbentaha niini nga opsyon mao nga ang virus kinahanglan nga anaa sa iyang replikatibo ug infective nga yugto aron mahibal-an ang viral nga mga protina.

Sa susama, ang mga pagsulay nga nakamatikod sa mga antibodies sa host gibase sa kusog sa pagtubag sa antibody nga nagdepende sa mga hinungdan sama sa edad, kahimtang sa nutrisyon, kagrabe sa sakit, ug pipila nga mga tambal o impeksyon nga nagpugong sa immune system. Usa ka dakong disbentaha sa kini nga kapilian mao nga ang mga antibodies gihimo sa daghang mga adlaw hangtod sa mga semana pagkahuman sa impeksyon sa SARS-CoV-2 nga virus ug ang usa kinahanglan maghulat nga dugay aron mahimo ang pagsulay. Nagpasabot kini nga ang pagdayagnos sa impeksyon sa COVID-19 base sa tubag sa antibody sa host sagad mahimo ra sa yugto sa pagbawi, kung ang daghang mga oportunidad alang sa klinikal nga interbensyon o pagpugong sa pagpasa sa sakit milabay na.

Sa pagkakaron, ang mga RDT nga gihisgutan sa ibabaw gi-aprobahan lamang sa usa ka setting sa panukiduki ug dili alang sa clinical diagnosis tungod sa kakulang sa datos (3, 4). Samtang nagkadaghan ang data sa epidemiological nga magamit alang sa COVID-19, daghang mga RDT ang maugmad ug maaprobahan isip mga pagsulay sa punto sa pag-atiman sa usa ka kahimtang sa klinika tungod kay makahatag kini mga resulta sa 10-30 minuto sukwahi sa mga pagsulay nga nakabase sa NAAT nga sa kasagaran kinahanglan. pipila ka oras aron mahibal-an ang sakit.

***

mga pakisayran:
1. WHO, 2020. Mga Rekomendasyon sa Estratehiya sa Pagsulay sa Laboratory para sa COVID-19. Interim nga Giya. 21 Marso 2020. Magamit online sa https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/331509/WHO-COVID-19-lab_testing-2020.1-eng.pdf Gi-access kaniadtong 09 Abril 2020
2. CDC 2020. Impormasyon para sa mga laboratoryo. Interim Guidance para sa mga Laboratories Anaa online sa https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nCoV/lab/index.html Gi-access kaniadtong 09 Abril 2020.
3. WHO, 2020. Tambag sa Paggamit sa Point of Care Tests. Siyentipikanhong Mubo. 08 Abril 2020. Magamit online sa https://www.who.int/news-room/commentaries/detail/advice-on-the-use-of-point-of-care-immunodiagnostic-tests-for-covid-19 Gi-access kaniadtong 09 Abril 2020.
4. ECDC, 2020. Usa ka Overview sa Rapid Test Situation para sa COVID-19 Diagnosis sa EU/EEA. 01 Abril 2020. European Center alang sa paglikay ug pagpugong sa sakit. Anaa online sa https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/overview-rapid-test-situation-covid-19-diagnosis-eueea Gi-access kaniadtong 09 Abril 2020

***

Rajeev Soni
Rajeev Sonihttps://web.archive.org/web/20220523060124/https://www.rajeevsoni.org/publications/
Si Dr. Rajeev Soni (ORCID ID : 0000-0001-7126-5864) adunay Ph.D. sa Biotechnology gikan sa University of Cambridge, UK ug adunay 25 ka tuig nga kasinatian nga nagtrabaho sa tibuuk kalibutan sa lainlaing mga institusyon ug multinasyonal sama sa The Scripps Research Institute, Novartis, Novozymes, Ranbaxy, Biocon, Biomerieux ug ingon usa ka punoan nga imbestigador sa US Naval Research Lab sa pagdiskubre sa droga, molekular diagnostics, protina ekspresyon, biologic manufacturing ug negosyo development.

Subscribe sa atong newsletter

Aron ma-update sa tanan nga labing bag-ong balita, mga tanyag ug espesyal nga mga anunsyo.

Labing kabantog nga Mga Artikulo

Deltamicron: Delta-Omicron recombinant nga adunay hybrid genome  

Ang mga kaso sa co-infections nga adunay duha nga mga variant una nga gitaho....

Space Biomining: Pag-abut Ngadto sa Human Settlements Labaw sa Yuta

Ang mga nahibal-an sa eksperimento sa BioRock nagpakita nga gisuportahan sa bakterya ang pagmina ...

Ang Sintetikong mga Embryo ba Magsugod sa Panahon sa Mga Artipisyal nga Organo?   

Gisundog sa mga siyentipiko ang natural nga proseso sa mammalian embryonic...
- Advertisement -
92,833fansSama sa
47,301mga sumusunodSunda
1,772mga sumusunodSunda
30subscriberssubscribe